北京蛋白质组研究中心是在中国科技部和北京市科委的支持下，由国家生物医学分析中心、江中制药集团、北京新医药和生物技术发展促进中心等单位共同发起，清华大学、北京大学、中国科学院生物物理研究所、中国医学科学院等单位参与共建的国家级蛋白质组研究机构。该中心座落于北京中关村生命科学园，集聚了以贺福初院士领衔的几十位海内外科学家，是促进中国蛋白质科学整体发展的科教研综合基地。同时，经国际“人类蛋白质组组织（HUPO）”认可，该中心已被推举为“人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）”的执行总部，整体负责其组织管理、交流与合作、教育与培训、数据集散等工作；并经中国科技部和“中国人类蛋白质组组织（CNHUPO）”认可，该中心为“中国人类肝脏蛋白质组计划（CNHLPP）”的总领导单位。目前，中心已建立的高通量技术系统有：1、蛋白质表达谱研究系统；2、蛋白质修饰谱研究系统；3、蛋白质相互作用研究系统；4、功能基因组研究系统；5、抗体工程研究系统；6、生物信息学研究系统；7、蛋白质新技术新方法研究系统；8、蛋白质工程研究系统。

美国AB公司 （Applied Biosystems） 是生命科学和实验室仪器领域全球品牌卓越的厂商，总部设在美国加州的福斯特市，在2005年度销售额近18亿美金，上市于美国纽约证交所。根据市场需求，美国AB公司为生命科学家提供基因研究，蛋白质研究和新药开发所需要的第一流的仪器平台，消耗品及软件系统，并对客户提供完善的技术支持和服务。用户通过仪器分析核酸（DNA, RNA），小分子化合物，和蛋白质，来进行科学探索和新药开发。美国AB公司的产品也服务一些生命科学领域研究以外的快速增长的应用市场，比如：身份识别（法医和亲子鉴定）；涉及到生物恐怖袭击或自然生物威胁的生物安全预警；食品和环境质量安全检测。美国AB公司的兄弟公司，塞雷拉基因公司（Celera Genomics）用专利基因和蛋白研究平台发展分子诊断产品，用于鉴别、认证新的药物靶点。公司在小分子诊断方面与Abbott保持战略性的合作。除此之外，塞雷拉基因公司正在开发新的分子诊断和基因药物测定。塞雷拉基因公司发现研究与药物靶点相抵抗的治疗抗体，具有深远的战略意义。

11月8日，北京蛋白质组研究中心和美国AB公司在北京宣布正式成立“蛋白质组合作实验室”，充分利用双方在现代科学理念和技术与人才方面的领导优势，共同致力于蛋白质组学前瞻性领域的基础研究与技术创新，加强蛋白质表达谱和修饰谱的研究力度，加快重大疾病标志物的发现和诊断，为蛋白质药物的创制和研发，促进人类健康做出积极贡献。

该合作实验室将配置美国AB公司最新推出的最高灵敏度和分析速度及最高样品分析通量的4800 MALDI TOFTOF™ 串联飞行质谱仪系统，和iTRAQ™ 蛋白定量标记试剂。结合该实验室已有的全负荷运转的美国AB公司的4700 MALDI TOFTOF™ 串联飞行质谱仪系统，该实验室的成立将进一步提升北京蛋白质组研究中心的科研仪器和平台建设水平，保障其科研成果的国际领先地位，为促进中国蛋白质科学的整体发展奠定更坚实的基础。